История начинается, когда студент старшей школы Mutou Kazuki умирает, спасая девушку от ужасного монстра, лишь для того чтобы проснуться, и осознать что это был лишь сон. После нападения на них с сестрой змееподобного монстра, он понимает, что это неспроста. Tsumura Tokiko, девушка из его сна, назвала этого монстра гомункулом. Kazuki умирает, защищая Tokiko, после чего она возвращает его к жизни с помощью своей алхимической медали. Совпадение? Что ждет их дальше…